概率图模型final project介绍

2024-10-28

该笔记主要讲解介绍了一下最终大作业的要求

数据:空间转录组,包括病理图像和基因-空间的表达矩阵 任务:贝叶斯网络对表达矩阵聚类、马尔可夫随机场进行图像分割 推荐使用LDA

1 聚类任务

理论部分:LDA模型的表示、给出LDA的模型推断和学习算法的流程以及详细的数学推导(例如变分推断或者吉布斯采样公式、参数更新公式) 无需推导概率论中的概率密度函数、确保推导的严谨性、需标出参考的教参、文献或者网页资料 代码部分:使用LDA进行聚类,使用物理坐标进行可视化 可以采用sklearn或者gensim

2 图像分割任务

用马尔可夫随机场进行病理图像分割,每个像素点就是一个观测接单,图像分割就是分割隐空间节点z的类 理论部分:完成概率图模型的表示,写出先验概率,局部条件概率,后验概率,给出采用的推断和学习方法、给出参数推导的过程以及表达式 编程:不能掉包,只能用基础的运算库或者图像读取的